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遗传多样性使猪流感成为挑战该病毒特别容易在猪之间传播

2021-01-18 14:24:35 默农

    甲型猪流感病毒(IAV-S)是美国及世界各地对猪生产系统构成挑战的主要呼吸道病原体之一,爱荷华州大学副教授DVM,Phil Gauger博士如是说。Gauger告诉Pig Health Today,此病毒很容易在猪之间传播,猪的长途运输已导致猪生产系统中的IAV-S问题。

 

生猪

 

“使IAV-S持续成为这样一个问题的其中一个最大因素可能是它的遗传多样性。这种遗传多样性最终引起了能够控制病毒的有效疫苗的开发问题。”Gauger说。

 

独特的遗传性

 

Gauger说,IAV-S是一种分段病毒,因此它可以经历一个被称为重配的过程。据美国国立卫生研究院所说,病毒重组“是一个基因重组过程,仅限于分段RNA病毒,其中,宿主细胞同时感染多种病毒可导致基因片段混排,产生具有新型基因组组合的子代病毒。”基因组的微小变化也可增加这种多样性,Gauger补充说。

 

另一个值得注意的因素是人与猪流感病毒之间的相互影响,他说。通常,人流感病毒会波及到猪。它们偶尔会被检测到,但偶尔其中一种人流感病毒会在猪群中树立自己的地位。它适应猪的身体,成为一个新的遗传分支,这是另一个遗传多样性水平,Gauger解释说。

 

提出适当的问题

 

无论是诊断还是监测IAV-S,提出适当的问题都很重要。

 

Gauger说:“我们已准备好进行分子诊断试验,将可以实际检测出病毒的存在,但我们也可以进行血清学试验,检测抗体的存在。”“我们回到病毒本身遗传多样性的同一个主题。”

 

确定畜群是否暴露于IAV-S及其疫苗接种状态时,这些试验缩小了确定范围。生产商需要考虑正在做抗体检测的猪的年龄,然后考虑诊断实验室所具备的条件,以得出所需的结果。

 

已有良好的检测技术来检测不同的IAV-S株,但兽医有时会混淆与诊断病毒相关的遗传多样性和测序。

 

“我们从检测猪的样本开始,以了解是否存在流感,然后我们检测特定的亚型......这些亚型主要是H1或H3病毒。然后我们通常需要进行测序,因为此信息将用于判断一种特定的疫苗在农场内是否有用。”Gauger说。

 

地方性传染

 

Gauger说,幼猪仍然和母猪在一起时发生的地方性传染常常被忽视。小猪可能没有出现疾病的临床体征,但它们仍然可以感染IAV-S,并且可以将病毒带入保育舍。

 

“更有创新性的其中一种样本类型是乳房擦拭物。”Gauger说。“这是沿着母猪乳房皮肤使用纱布垫和擦拭物的地方。”

 

很明显,那是哺乳小猪和鼻分泌物会积聚的地方。乳房擦拭物可浸泡在培养基中,然后作为群体型样本经过IAV-S检测。

 

Gauger说:“(这项检测)很好地描述了在那个年龄已经流行的流感类型。”

 

在保育舍阶段,鼻擦拭物可代替鼻拭子,后者会需要更大的工作量。

 

“可以用纱布擦拭猪鼻子,然后就采集到鼻分泌物。”他说。“它们对检测流感也有好处。”

 

提高检测水平

 

有时兽医和生产商认为,如果他们已经鉴定出H1或H3的特定亚型,则不需要对病毒进行任何其他遗传表征,但Gauger说这还不够。

 

Gauger忠告,不花时间对病毒进行测序会错过机会。

 

他说:“可以很容易地从诊断实验室报告中获得病毒序列,把它放入一个带有之前的序列的程序中,得到畜群中流感暴露的历史图片。”此过程使生产商及其兽医可以监测病毒,以了解病毒是否随着时间推移缓慢变化,以及是否需要新的疫苗。

 

实时聚合酶链式反应试验可以鉴别猪是否呈IAV-S阳性或阴性,也可以提供“循环阈值(Ct)时间”。Ct定义为荧光信号越过阈值(即超过背景水平)所需的循环数。

 

Gauger说:“Ct基本上与样本中的病毒量呈负相关。”“我与不同的兽医一起工作,他们打电话到诊断实验室并且对他们得到的结果有疑问,此时我正在研究Ct值,以确定进行一些亚型分型或测序是否会取得成功。”

 

PCR试验具有高灵敏度,可检测出样本中的少量病毒。如果存在病毒但浓度低,Gauger建议,从受到可能更强烈的IAV-S影响的猪中采集额外样本。然后将这些值与病例的临床背景相关联。

 

关键信息

 

Gauger建议,兽医和生产商应与诊断实验室的人员交谈,以便更好地了解各自农场的IAV-S检测结果。

 

他说:“如果要进行测序,但不了解结果,那么将没有机会通过循证决策使畜群内部发生任何有效益的变化,特别是在使用何种疫苗方面。”

 

了解感染的起源及其持续存在的位置也很重要。

 

Gauger指出:“我们仍然担心可能携带新流感毒株的外来小母猪,因此在那里进行一些诊断性检测或监测是很重要的。”

 

从控制的角度来说,常规监测和测序至关重要。Gauger说:“如果要在这方面做出改变,这一点至关重要。”

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